ჯონ უიკი - ყოფილი დაქირავებული მკვლელი - ცხოვრობს ზომიერი ცხოვრებით, როდესაც ბოროტმოქმედი იპარავს მის საყვარელ1969 წლის MUSTANG-ს და გზად კლავს ძაღლს დეიზის, რომელიც მისი გარდაცვლილი მეუღლის ერთადერთი ცოცხალი შეხსენება იყო. ჯონს
ინდი ახალ ეპოქაში ამოჰყოფს თავს და თავის დასამკვიდრებლად იბრძვის სამყაროში, რომელსაც ჩამორჩა. თუმცა როცა ნაცნობი ბოროტება ძველი მეტოქის სახით გამოჰყოფს საცეცებს, ინდის მოუწევს, ქუდი დაიხუროს და მათრახი მოიმარჯვოს, რათა
ცივი ომი გრძელდება, საბჭოთა აგენტები თვალს ადევნებენ პროფესორ ჰენრი ჯონსს. ამ დროს ერთი ახალგაზრდა მას კოდირებულ გზავნილს გადასცემს ხანდაზმული, ჭკუასუსტი კოლეგისგან, ჰენრი ოქსლისაგან. საბჭოელები, ბრწყინვალე ირინა სპალკოს
სამი წელი გავიდა მას შემდეგ რაც მან უფლის აღთქმის კიდობანი დაიბრუნა. ახლა ჯონსმა დაიბრუნა ექსპონატი, რომელიც მან ბავშვობაში განძის მაძიებლებისგან მოიპოვა: ფრანცისკო დე კორონადოს ჯვარი. ჯონსი შეიტყობს სხვა არტეფაქტის- "წმინდა
ინდიანა ჯონსის მეორე ნაწილში,იგი მიემგზავრება მომღერალ ქალთან და თავის პატარა მეგობართან ერთად გიმალაების შუაგულში.მათ გზაში სხვა და სხვა დაბრკოლებების გადალახვა მოუწევთ...
ცნობილი მეცნიერების სპეციალისტმა დავალება მიიღო ამერიკის მთავრობისგან,რომ იგი უნდა გაემგზავროს წმინდა კიდობნის მოსაძებნად.მაგრამ მანამდე ეს დავალება ასევეე მიიღეს ჰიტლერის აგენტებმა...
მას შემდეგ, რაც ეროვნული საგანძურის ძიების პირველი მცდელობისას მათ სიმდიდრე და სიყვარული იპოვეს, ბენჟამინ ფრანკლინ გეითსსა და დოქტორ აბიგაილ ჩეისს, კვლავ უერთდებათ ენაკვიმატი პარტნიორი - რაილი პული, რათა კიდევ ერთხელ იმოგზაურონ
თანამედროვე განძის მაძიებლები, არქეოლოგ ბენ გეითსის ხელმძღვანელობით განძის სკივრს ეძებენ, რომელიც გადმოცემის მიხედვით ჯორჯ ვაშინგტონს, თომას ჯეფერსონსა და ბენჯამინ ფრანკლინს ჰქონდათ გადამალული დამოუკიდებლობისათვის ომის პერიოდში.
